Если у Вас не трудовой договор - то нужно будет открыть ИП в Германии
Частный предприниматель в Германии: регистрация, налоги
Про то, что Вы должны будете Германии - тут в разделе предприниматель
Жизнь в Германии и работа удалённо за границей , в среднем должны будете заплатить 40-45% от дохода, этого не избежать.
По поводу вопроса 2 - юридически по закону о двойном налогообложении Вы должны освободиться от налога в той стране, в которой Вы не проживаете. Т.е. юридически Вы можете не платить налог в РФ. На практике - как Вы объясните это налоговой РФ, большая загадка, тем более в нынешней ситуации. Т.е., скорее всего, Вы будете платить и там, и там.
По поводу налоговых классов - когда у одного члена ИП, там иначе налогообложение считается. Т.е. Вам нужно будет нанять налогового консультанта, вести бухгалтерию и т.д., а это тоже расходы