В Германии раз в год подается налоговая декларация. В ней указываются все доходы за календарный год независимо от того в какой стране и по какой причине они получены. На основании поданной декларации происходит годовой перерасчёт суммы налога. В результате вам либо выставят счёт на оплату неоплаченной части налога, либо, наоборот, вернут переплаченное.
Таким образом, подавая декларацию за 2020 год, из которого половину вы работали в РФ, вам все равно необходимо этот доход указать.
Если же по приезду в Германию, вы, помимо работы в Германии, получаете ещё какой-то доход, например подработка удаленная для другой страны, то вам нужно сразу же регистрировать себя как индивидуального предпринимателя.